愛媛から和歌山までの交通手段について、料金、時間、労力の観点から考えてみました。
松山駅から和歌山駅までの移動手段について、様々な行き方を調べました。

飛行機
例
伊予鉄バス 松山空港リムジンバス 松山空港（バス）行
07:05　ＪＲ松山駅
07:20　松山空港

全日空 ANA1632便 大阪空港[伊丹]行
08:00　松山空港
08:50　大阪空港[伊丹]

大阪空港交通 あべの橋 あべの橋行
09:20　大阪〔伊丹〕空港
09:50　あべの橋

紀州路快速 和歌山行
09:59　あべの橋
11:09　和歌山駅

移動時間 4時間6分
運賃料金　23,460円

新幹線
例
ＪＲ予讃線 特急しおかぜ6号 岡山行
06:13　松山駅
09:00　岡山駅

ＪＲ山陽新幹線 さくら540号 新大阪行
09:09　岡山駅
09:53　新大阪駅

ＪＲ大阪環状連絡線 特急くろしお7号 白浜行
10:15　新大阪駅
11:17　和歌山駅

移動時間 5時間4分
運賃料金　12,460円

高速バス
例
京都・大阪・兵庫-愛媛/松山エクスプレス号[高速バス] 高速バス 松山エクスプレス号 ＵＳＪ行
05:50　ＪＲ松山駅
10:30　三宮バスターミナル

ＪＲ東海道山陽本線新快速 長浜行
10:37　三ノ宮駅
10:58　大阪駅

紀州路快速 西九条,天王寺方面
11:08　大阪駅
12:37　和歌山駅

移動時間 6時間51分
運賃料金　8,240円

普通電車
例
サンポート南風リレー号 高松（香川県）行
05:57　松山駅
10:04　坂井駅

ＪＲ予讃線 快速マリンライナー20号 岡山行
10:07　坂井駅
10:48　岡山駅

ＪＲ赤穂線 播州赤穂行
10:56　岡山駅
12:08　播州赤穂駅

ＪＲ赤穂線 姫路行
12:09　播州赤穂駅
12:40　姫路駅

ＪＲ東海道山陽本線新快速 野洲行
12:42　姫路駅
13:43　大阪駅

紀州路快速 西九条,天王寺方面
13:53　大阪駅
15:25　和歌山駅

移動時間 9時間28分
運賃料金　7,820円

車高速あり
松山駅から和歌山駅までのルートで計算
総距離 386.5km
所要時間 5時間9分
一般料金 14,010 円
ETC料金 8,730 円 (普通車)

車の場合はガソリン代がかかります。
1ℓ=10キロ計算　1ℓ=150円計算

386km 39ℓ　5,850円　愛媛から和歌山までのガソリン代

高速料金一般+ガソリン代=19,860円

車高速なし+フェリーなし
総距離 429.3km
所要時間 13時間58分
一般料金 3,600 円
ETC料金 1,650 円 (普通車)

429km 43ℓ　6,450円+3600円=10,050円

車高速なし+フェリーあり
総距離 250.6km
所要時間 8時間34分

南海フェリー　徳島港乗り場
住所／徳島市南沖洲五丁目7番39号
お問合せ／TEL：088-636-0750

250km 25ℓ　3,750円

フェリー運賃　徳島⇒和歌山

4ｍ未満　7,600円(通常運賃)+500円(燃料調整金)=8,100円

車1台につき運転者1名分の乗船代含む

ガソリン代3,750円+フェリー代8,100円=11,850円

フェリー代は、時期によりますので正式には公式サイトを確認下さい。

まとめると
飛行機　4時間6分　23,460円
新幹線　5時間4分　12,460円
高速バス　6時間51分　8,240円
普通電車　9時間28分　7,820円
車高速あり　5時間9分 19,860円
車高速なし+フェリーなし　13時間58分 19,860円　10,050円
車高速なし+フェリーあり　8時間34分+フェリー乗車時間2時間15分+フェリー待ち時間　11,850円

愛媛から松山まではいろんなルートがあり悩みますね。
早く行きたい場合は、飛行機か新幹線。
比較すると1時間違い程度なら新幹線にメリットはありそうですね。

車を使わない場合の移動で安く済ませたいなら高速バスか普通電車の乗り継ぎ。
コストと時間を比較して選びましょう。高速バスは、曜日や閑散期か繁忙期で運賃も違うので調べて見て下さい。
車の場合は、高速を使う場合は、　高速を使ったほうが早いんですが、遠回りになるんですよね。

高速を使わずフェリーを使うコースもおすすめです。
利用状況に合わせて、どのルートか事前に決めておきましょう。
また、休憩も十分にとれるように余裕のある計画を立てましょう。