京都から水戸までの交通手段について、料金、時間、労力の観点から考えてみました。
京都駅から水戸駅までの移動手段について、様々な行き方を調べました。

新幹線
例
ＪＲ東海道新幹線 のぞみ204号 東京行
06:30　京都駅
08:36　品川駅

ＪＲ東海道本線 特急ひたち5号 いわき行
08:45　品川駅
10:14　水戸駅

移動時間 3時間44分
運賃料金　16,030円

高速バス
例
ＪＲ東海道本線 米原行
05:49　京都駅
06:56　米原駅

ＪＲ東海道本線特別快速 浜松行
07:07　米原駅
08:12　名古屋駅

JR高速バス 東名ハイウェイバス 東京駅〔日本橋口〕行
09:00　名古屋駅
14:01　東京駅〔日本橋口〕

JR高速バス みと号 水戸駅南口行
14:20　東京駅〔日本橋口〕
16:14　水戸駅南口

移動時間 10時間30分
運賃料金　9,920円

普通電車
例
ＪＲ東海道本線 米原行
05:49　京都駅
06:56　米原駅

ＪＲ東海道本線特別快速 浜松行
07:07　米原駅
09:48　浜松駅

ＪＲ東海道本線 静岡行
09:52　浜松駅
11:02　静岡駅

ＪＲ東海道本線 沼津行
11:13　静岡駅
12:10　沼津駅

ＪＲ東海道本線 熱海行
12:21　沼津駅
12:41　熱海駅

ＪＲ上野東京ライン 高崎〔東京経由〕行
12:49　熱海駅
14:44　上野駅

ＪＲ常磐線 水戸行
14:52　上野駅
16:59　水戸駅

移動時間 11時間10分
運賃料金　9,610円

車高速有り
総距離 572.3km
所要時間 7時間29分
ETC料金 13,760 円 (普通車)
一般料金 13,760 円

車の場合はガソリン代がかかります。
1ℓ=10キロ計算　1ℓ=150円計算

572km 57ℓ　8,550円 京都から水戸までのガソリン代

高速料金一般+ガソリン代=22,310円

車高速なし
総距離 598.2km
所要時間 19時間57分

60ℓ　9000円　

まとめると
新幹線　3時間44分　16,030円
高速バス 10時間30分　9,920円
普通電車　11時間10分　9,610円　
車高速あり　7時間29分　22,310円
車高速なし　19時間57分　9,000円　

京都から水戸までは約600km
新幹線で約4時間かからないぐらい。
安く行きたい場合は高速バスか普通電車。
車の場合は高速で7時間半ぐらい。休憩が十分とれるようにプラス2時間はみておいたほうがいいと思います。