三重から長崎までの交通手段について、料金、時間、労力の観点から考えてみました。
津駅から長崎駅までの移動手段について、様々な行き方を調べました。

飛行機
例
近鉄名古屋線 伊勢中川行
05:53　津駅
06:07　伊勢中川駅

近鉄大阪線特急 大阪上本町行
06:29　伊勢中川駅
07:53　大阪上本町駅

大阪空港交通 近鉄上本町-伊丹空港 大阪国際空港〔北ターミナル〕行
08:00　大阪上本町駅
08:30　大阪国際空港〔南ターミナル〕

日本航空 JAL2373便 長崎空港行
09:15　大阪空港[伊丹]
10:30　長崎空港

長崎県営バス/長崎バス 長崎空港-長崎〔出島道路経由〕 ココウォーク茂里町行
10:45　長崎空港
11:28　長崎駅前

移動時間 5時間35分
運賃料金　33,440円

新幹線
例
近鉄名古屋線急行 近鉄名古屋行
06:07　津駅
07:14　近鉄名古屋駅

ＪＲ東海道新幹線 のぞみ99号 博多行
07:29　近鉄名古屋駅
10:46　博多駅

ＪＲ鹿児島本線 特急かもめ17号 長崎（長崎県）行
10:55　博多駅
12:49　長崎駅

移動時間 6時間42分
運賃料金　21,300円

高速バス+特急電車
例
近鉄名阪特急 大阪難波〔近鉄・阪神線〕行
06:50　津駅
08:14　鶴橋駅

近鉄難波・奈良線 尼崎〔阪神線〕行
08:20　鶴橋駅
08:46　尼崎駅〔阪神線〕

阪神本線直通特急 山陽姫路行
08:48　尼崎駅〔阪神線〕
09:11　神戸三宮駅〔阪神線〕

高速バス ハーバーライナー 広島バスセンター行
09:20　神姫バス三ノ宮バスターミナル
13:22　新白島駅

ＪＲ山陽本線 岩国行
13:48　新白島駅
14:36　岩国駅

ＪＲ山陽本線 新山口行
14:40　岩国駅
16:33　新山口駅

ＪＲ山陽本線 下関行
16:47　新山口駅
18:01　下関駅

ＪＲ山陽本線 小倉（福岡県）行
18:05　下関駅
18:18　小倉駅

ＪＲ鹿児島本線 特急きらめき9号 博多行
18:21　小倉駅
19:12　博多駅

ＪＲ鹿児島本線 特急かもめ41号 長崎（長崎県）行
19:15　博多駅
21:23　長崎駅

移動時間 14時間33分
運賃料金　17,640円

高速バス
例
近鉄名古屋線急行 松阪行
05:32　津駅
05:46　伊勢中川駅

近鉄大阪線急行 名張行
05:54　伊勢中川駅
06:34　名張駅

近鉄大阪線快速急行 大阪上本町行
06:51　名張駅
07:55　鶴橋駅

近鉄難波・奈良線快速急行 神戸三宮〔阪神線〕行
08:07　鶴橋駅
08:58　神戸三宮〔阪神線〕

高速バス ハーバーライナー 広島バスセンター行
09:20　神姫バス三ノ宮バスターミナル
13:22　新白島駅

ＪＲ山陽本線 岩国行
13:34　新白島駅
14:23　岩国駅

ＪＲ山陽本線 新山口行
14:40　岩国駅
16:33　新山口駅

ＪＲ山陽本線 下関行
16:47　新山口駅
18:01　下関駅

ＪＲ山陽本線 小倉（福岡県）行
18:05　下関駅
18:18　小倉駅

福岡-長崎/出島号[高速バス] 長崎県営バス [高速]出島号 長崎駅前（バス）行
19:00　小倉駅前〔コレット前〕
22:08　長崎駅前

移動時間 16時間36分
運賃料金　14,400円

普通電車
例
近鉄名古屋線急行 伊勢中川行
06:53　津駅
07:08　伊勢中川駅

近鉄大阪線急行 大阪上本町行
07:15　伊勢中川駅
09:13　鶴橋駅

ＪＲ大阪環状線 京橋（大阪府）,大阪方面
09:20　鶴橋駅
09:35　大阪駅

ＪＲ東海道山陽本線新快速 姫路行
10:00　大阪駅
11:03　姫路駅

ＪＲ山陽本線 播州赤穂行
11:06　姫路駅
11:25　相生駅

ＪＲ山陽本線 岡山行
11:27　相生駅
12:38　岡山駅

ＪＲ山陽本線 三原行
12:56　岡山駅
14:28　三原駅

ＪＲ山陽本線 岩国行
14:44　三原駅
17:00　岩国駅

ＪＲ山陽本線 下関行
17:13　岩国駅
20:29　下関駅

ＪＲ山陽本線 新田原行
20:35　下関駅
20:52　西小倉駅

ＪＲ鹿児島本線区間快速 久留米行
20:57　西小倉駅
22:50　鳥栖駅

ＪＲ長崎本線 肥前山口行
23:02　鳥栖駅
23:44　肥前山口駅

ＪＲ長崎本線 長崎（長崎県）行
05:00　肥前山口駅
07:01　長崎駅

移動時間 24時間8分
運賃料金　12,800円

車高速有り
総距離 872.7km
所要時間 11時間3分
一般料金 18,000 円
ETC料金 12,760 円 (普通車)

車の場合はガソリン代がかかります。
1ℓ=10キロ計算　1ℓ=150円計算

872km 87ℓ　13,050円　三重から長崎までのガソリン代

高速料金一般+ガソリン代=31,050円

車高速なし
総距離 847.2km
所要時間 28時間12分
ETC料金 150 円 (普通車)
一般料金 150 円

85ℓ　12,750円+150円=12,900円

まとめると
飛行機　5時間35分　33,440円
新幹線　6時間42分　21,300円
高速バス+特急電車 14時間33分　17,640円
高速バス　16時間36分　14,400円
普通電車　24時間8分　12,800円
車高速あり 11時間3分 31,050円
車高速なし 28時間12分 12,900円

三重から長崎までは約870km
飛行機で約5時間半。新幹線で7時間かからないぐらい。
安く行きたい場合は、高速バスや特急を組み合わせましょう。
普通電車だと、その日中に着くのは難しそうです。
車の場合はかなり長距離になるので、十分に休憩が取れるように計画しましょう。